<<
>>

ВВЕДЕНИЕ

В настоящее время известно не менее 1 500 генов, относящихся к различным генным сетям, для которых показана ассоциация с МФЗ человека. Многие из этих генов тестированы в различных диагности­ческих и лабораторных центрах по молекулярной биологии РФ, в том числе и в лаборатории пренатальной диагностики НИИ акушерства и гинекологии им.

Д. О. Отта СЗО РАМН. Информация о других генах почерпнута, главным образом, из зарубежных источников. Большин­ство приведенных генов и их полиморфизм рассмотрены в специаль­ных разделах данной монографии, посвященных той или иной мульти­факторной патологии и суммированных в главе 6. Приведенный ниже каталог (табл. 5.1) содержит только краткую информацию о каждом гене, которая облегчает поиск и знакомство с функциональными осо­бенностями аллельных вариантов гена, его ассоциацией с теми или иными МФЗ.

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Биотранс формация/ Ыо^апзйэгтайоп
Фаза І/РІіазе I
108330 СУРМІ Цитохром Р450 1А1 15ц22-ц24 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм полициклических арома­тических углеводородов: бензопирен, нитрозамины 11, *2А, *2В, *4: С4887А, А4889С, Т6235С Рак легких (*2В, *2А), коло­ректальный рак (*2В, *2А), рак полости рта (*2В), рак молочной железы (*2В), почечно-клеточная карцинома (*2А, *2В, *4), острый лейкоз (*2А), острый лимфоблас­тный лейкоз (*2А), В-клеточный хронический лимфолейкоз (*2А, *2В, *4)
124060 СУР М2 Цитохром Р450 1А2 15ц22-

ціег

Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм полициклических арома­тических углеводородов, кофеина, диазепама, верапа- мила, метадона, теофилли- на, эстрадиола *1В: 1545Т>С Онкологические заболевания.
Повышает риск возникновения ин­фаркта миокарда с каждой лишней выпитой чашкой кофе
122720 СУР2А6 Цитохром Р450 2А6 19ЦІ3.2 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм никотина, кумарина, цик- лофосамида, ритонавира, парацетамола, вальпроевой кислоты *2 *3 *4’ ЬеиІбОНіз, конверсия, делеция Снижение риска развития рака лег­кого (*4), снижение риска развития табачной зависимости (*2, *3), более успешное лечение табачной зависимости (*2)
Список генов-кандидатов, ассоциированных с некоторыми частыми МФЗ

106 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
601771 СУРІВІ Цитохром Р450 1В1 2р22-р21 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм холестерола, стероидов и липидов У432Ь Онкозаболевания, гормональные нарушения.
Глаукома
123930 СУРТВб Цитохром Р450 2В6 19ц13.2 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм никотина, цитостатиков (циклофосамид), проти­вовирусных препаратов (эфавиренца и невира­пина), антидепрессантов (бупропиона), анастетиков (пропофола), синтетичес­ких опиоидов (метадона), эндогенных стероидов, вальпроевой кислоты *4 *5

*6: 64С>Т

(Агё22Су8);

785А>С

(Ьуз262А^);

14590Т

(Агё487Су8);

51 бО>Т

(01и172НІ8)

Затрудненное лечение табачной зависимости
124030 СУРЮб Цитохром Р450 206 22ц13.1 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм р-адреноблокаторов, анти­депрессантов, антипсихо- тропных веществ, антиарит- мических, нейролептиков, противогипертонических препаратов, ингибиторов монооксидредуктазы, произ­водных морфина, нейро­трансмиттеров (допаминов), анальгетиков, опиатов *3, *4:

Беї 2637А, 1934 С>А

Рак легкого (быстрые метаболай- зеры), плоскоклеточная карцинома полости рта (медленные метабо- лайзеры), рак простаты, острый лимфобластный лейкоз (медленные метаболайзеры), острый миело- бластный лейкоз (медленные мета­болайзеры), болезнь Паркинсона

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
601130 СУР2С9 Цитохром Р450 2С9 10ц24 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм ингибиторов ангиотензино- вых рецепторов (лозартана и ирберсартана), антико­агулянтов (варфарина), сахароснижающих препа­ратов (гаипизида), проти­восудорожных препаратов (фенитоина, диазепама), антидепрессантов (амитрип- тилина, кломипрамина, имипрамина), ингибиторов протоновых помп (омепразо- ла), нестероидных противо­воспалительных препаратов (диклофенака, ибупрофена, пироксикама), толбутамина *9 *3-

430 С>Т, 1075 А>С

Рак легкого (аденокарцинома) (*2), колоректальный рак (*2), В-кле- точный хронический лимфолейкоз (*2), глубокая депрессия (*3), эпилепсия
124020 СУР2С19 Цитохром Р450 2С19 10ц24.1-

q24.3

Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метабо­лизм противосудорожных препаратов, ингибиторов протоновых помп (омепра- зол), прогуанила, барби­туратов, рифампицина, симвастатина *2: 68Ш>А Острый лейкоз
108 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
609300 СУР17А1 Цитохром Р450 17А1 10q24.3 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, участие в метаболизме стероидных гормонов (прогестины, минералкортикоиды, глю­кокортикоиды, андрогены и эстрогены) rsl042386

rs743572

Онкологические заболевания.
Позволяет прогнозировать риск развития опухолей преимуществен­но молочных желез
107910 СУР19А1 Ароматаза (цитохром Р450 19) 15 q21. Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм ароматических групп эстро­генов и андрогенов А1-А6:

(ТТТА)7-13

Онкологические заболевания эндометрия (А1, А6), рак молоч­ной железы (А2/А2), рак простаты (А1/А1, А1/А2)
124040 СУР2Е1 Цитохром Р450 2Е1 10q24.3-

qter

Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм этанола, ацетона, бензола, бензопирена, тетрахлорис- того углерода, канцерогенов табачного дыма Rsal

(-1019ОТ);

Pstl

(-1293G>C);

Dral

(-7668T>C);

TagI

(-989600)

Гепатома печени, алкогольная болезнь печени 4.7 — гепато­ма, индуцированная этанолом;

4.5 — алкоголь-зависимые болезни печени; 1.4 — опухоли (глиомы) (Ыяа!); колоректальный рак, рак желудка у курильщиков; рак груди у курильщиц, лимфома 2.1 — рак простаты

124010 СУРЗА4 Цитохром Р450ЗА4 7q22.1 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, мета­болизм лекарственных препаратов, тестостерона, эстрогенов *1B 5’ imtranslated region — 392A>G Мелкоклеточный рак легкого, особенно у курящих, лейкемия, связанная с лечением эпидофило- токсином, рак простаты
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 109

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
605325 СУРЗА5 Цитохром Р450ЗА5 7ц22.1 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, метаболизм нифепидина, циклоспори­на, стероидных гормонов (тестостерона, прогестеро­на, андростендиона) *ЗА:

6986 А>С

Пониженное кровяное давление, снижение риска развития гиперто­нии, снижение риска развития рака легкого
168820 РОМ Параокса-

наза

7ц21.3 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, инактива­ция фосфорорганических соединений, орагнофос- фатов, карбаматов, эфиров уксусной кислоты, включая детоксикацию боевых от­равляющих веществ (зарин, замай, табун) 01п192А^

(584А>0);

Ьеи55Ме1

(172Т>А)

ИБС, коронарная болезнь (01п192А^), болезнь Паркинсона, атеросклероз, церебральный ин­фаркт, кардиоваскулярные заболе­вания (Ьеи55Ме1)
103720 АВН1В

(АВН2)

Алкоголь-

дегидроге­

наза

4ц22 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, катаболизм этанола и других спиртов, окисление спиртов до аль­дегидов *2: А^47Шз, 141 С>А Повышенная чувствительность к этанолу, протективное действие в отношении алкоголизма, пониже­ние риска алкогольного цирроза печени, рака груди, пищевода, желудка
100650 АТВН2 Альде-

гиддегид-

рогеназа

митохонд­

риальная

12ц24.2 Первая фаза детоксикации ксенобиотиков, катаболизм алкоголя, превращение токсичных альдегидов в карбоновые кислоты *2: 01и487Ьуз (15ЮО>А) Гепатоцеллюлярная карцинома, рак пищевода, глотки, ротовой полос­ти, алкогольная болезнь, цирроз печени
110 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Фаза II/ Phase II
612182 NAT2 Ариламин- N-ацетил- трансфе- раза 2 8р23.1-

р21.3

Вторая фаза детоксикации ксенобиотиков, Ы-ацети- лирование, метаболизм противотуберкулезных препаратов (изониазид, р- анизид), антиаритмических препаратов (прокаинамид), амонафида, 2-аминофлуо- рена, токсических нитроза- минов в сигаретном дыме, оксидантов, пестицидов *4 (луО (Т341С), С481Т *5 О590А *6 С857А *7 БІ, Б2, БЗ *5, *6, *7 — медлен­ные ацетиля- торы Рак легкого (медленные ацетиля- торы, *5В/*6), плоскоклеточная карцинома легкого (медленные ацетиляторы, *5В/*6), рак молочной железы (медленные ацетиляторы, быстрые ацетиляторы, быстрые/про- межуточные метаболайзеры, *6/*6), рак мочевого пузыря (медленные ацетиляторы, *5В), колоректаль­ный рак (быстрые ацетиляторы), множественная миелома (медленные ацетиляторы), острый лимфобласт­ный лейкоз (медленные ацетилято­ры, *5С, *7В), контактная аллергия (кожная) — чувствительность к пара- замещенным ариламинам (быстрые ацетиляторы (*4)), атопические за­болевания (медленные ацетиляторы (гомозиготы по *5, *6 и *7 аллелям))
187680 ТРАТТ Тиопу-

ринметил-

трансфе-

раза

6р22.3 Вторая фаза детоксикации ксенобиотиков, Б-мети- лирование, метаболизм цитостатиков (6-меркап- топурина, азатиоприна, 6-тиогуанина) *ЗА,

А1а154ТЪг

*ЗВ;

Туг240Су8 *ЗС; *30, А1а80Рго *2; *4 *5 *6 *7* Аг^215Шз *8

Гемобластоз, тиопуриновая токсич­ность у детей с острым лимфобластным лейкозом при тера­пии 6-меркаптопурином
5.
Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 111

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
132810 ЕРНХ1 Микросо- мальная эпоксид- гидр ол аза 1ц42.1 Вторая фаза детоксикации ксенобиотиков, водная конъюгация, метаболизм высокоактивных производ­ных эпоксида Б, Б:

Тугі ІЗНів,337 Т>С;

Шз139А^, 415 А>С

Хронический бронхит, эмфизема, обструктивная пневмония, гестоз (генотипы 5/5, 5/ЛО, рак легких, рак яичников
600436 СБТТІ Глюта- тиои-Б- трансфе- раза Т1 22ц11.2 Вторая фаза детоксикации ксенобиотиков, глютатион опосредованное связывание электрофильных соедине­ний, играет важную роль в обеспечении резистентнос­ти клеток к перекисному окислению жиров, свобод­ным радикалам,алкилиро­ванию белков 0/0 Рак легкого, рак мочевого пузы­ря, множественная миелома, рак молочной железы, неходжкинская лимфома, острый миелобластный лейкоз, бронхиальная астма, эпите­лиальный рак яичников, эндомет­риоз
138350 СБТМІ Глюта- тиои-Б- трансфе- раза М1 ІрІЗ.З Вторая фаза детоксикации ксенобиотиков, глютатион опосредованное связывание электрофильных соедине­ний, играет ключевую роль в обеспечении резистент­ности клеток к перекисному окислению жиров, свобод­ным радикалам, алкилирова­нию белков, в предотвраще­нии повреждений ДНК 0/0 Рак легкого, рак молочной желе­зы, плоскоклеточная карцинома легкого, Т-клеточная неходжкинская лимфома, рак мочевого пузыря, колоректальный рак, рак яичников, эндометриоз, эндометриодный рак яичников, эндометриодный/светло- клеточный рак яичников, острый лейкоз, острый лимфобластный лей­коз, хронический бронхит, алкоголь­ный цирроз, бронхиальная астма
112 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
134660 СБТРІ Глюта- TIIOH-S- трансфе- раза Р 11ц13 Вторая фаза детоксикации ксенобиотиков, глютатион опосредованное связы­вание гидрофобных и электрофильных соедине­ний, играет важную роль в детоксикации пестицидов и в процессах канцероге­неза *В, *С: Ilel05Val (313A>G); Alai 14 Val (3410T) Рак легкого, кишечника, яичников, семенников, мочевого пузыря, по­чек, гортани, кожи, привычное не­вынашивание, спонтанные аборты
Фаза Ill/Phase III
171050 MDR1 Гликопро­теин Р 1 7q21 Л Третья фаза детоксикации ксенобиотиков, АТФ- зависимое выведение ксенобиотиков, субстра­тами являются сердечные гликозиды, блокаторы медленных кальциевых ка­налов, статины, макролиды, цитостатики, противовирус­ные препараты 34350T Эффективность и безопасность лекарственной терапии
Липидный обмен/lipid metabolism
107680 АРОАІ Аполипо-

протеин

А1

Ilq23-q24 Метаболизм липопроте­инов, главный компонент липопротеинов высокой плотности -75G>A

+83C>T,

+930T

Сердечно-сосудистые заболевания, гипертриглицеридемия, ненейропа­тические амилоидозы
5.
Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 113

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
107690 АРОА-ІУ Аполипо-

протеин

А4

11ц23 Метаболизм липопротеи­нов, ингибирует окисление липопротеинов низкой плотности 127А>С

Т1тг3478ег

Сердечно-сосудистые заболевания, гипертриглицеридемия
606368 АРОА5 Аполипо-

протеин

А5

11ц23 Метаболизм липопроте­инов, важнейший фактор регуляции уровня тригли­церидов +553С>Т -1131 Т/С - 3 А>С +56 С>С 8ег19Тгр Главный фактор риска коронарной болезни сердца, метаболический синдром (8ег19Тгр)
107730 АРОВ Аполипо- протеин В 2р24-р23 Гомеостаз холестерина З’АРОВ-

УОТЯ

С7623Т

С12619А

Сердечно-сосудистые заболевания, гиперхо листер инемия
107720 АроСШ Аполипо-

протеин

СЗ

11ц23.1-

ц23.2

Катаболизм триглицеридов. Ингибирует липопроте- инлипазу и печеночную липазу -2854 О/Т -482С>Т 3175С>0 32060>Т 3238С>0 ^Я) С5163С ИНСД, аллель 51630 (82) ассоци­ирован с развитием ишемической болезни сердца, атеросклерозом и тромбозами. Аллель 82 приводит к гипертриглицеридемии в результате торможения активности липопроте- идной липазы
107741 АРОЕ Аполипо- протеин Е 19ц13.2 Метаболизм липопротеинов СуєША^, Argl58Cys (Е2, ЕЗ,Е4) Аллели Е2, Е4 ассоциированы с гиперхолестеринемией и гипертри- глицеридемией.
Показана ассоци­ация аллеля Е4 с атеросклерозом, семейной гиперлипопротеинемией III типа, ИБС, болезнью Альцгеймера
114 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
163729 NOS3 Эндоте­

лиальная

синтетаза

оксида

азота

7q36 Катализирует реакцию образования окиси азота (N0) из Ь-аргинина, участ­вует в торможении работы сократительного аппарата сосудистых гладкомышеч­ных элементов и в синтезе N0 в эндотелии и, следова­тельно, в регуляции сосу­дистого тонуса, кровотока и артериального давления 4а/4Ь (4/5) Glu298Asp Аллели 4 (4а) и Авр298 (Т894) ассо­циированы с рядом сердечно-сосу­дистых заболеваний (ишемическая болезнь сердца, гипертоническая болезнь, инфаркт миокарда, диабе­тическая нефропатия при сахар­ном диабете, атеросклероз и др.). Аллель 4Ь является генетическим маркером тяжелой формы чистого гестоза
163731 NOS1 Нейро­

нальная

синтетаза

оксида

азота

12q24.2-

q24.31

Катализирует реакцию об­разования окиси азота (N0) из Ь-аргинина, в качестве нейротрансмиттера G-84A exon 1с ААТ-пов- торы в 20-м интроне Число ААТ-повторов в 20-м ин­троне гена достоверно связано с количеством оксида азота (N0) в выдыхаемом воздухе и наличие C -2578 С>А 1154G>A С ердечно-сосудистые заболевания, инсулиннезависимый сахарный диабет, болезнь Альцгеймера, диа­бетическая ретинопатия
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 115

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Коагуляция и клеточная aдгeзия/coaglllatioll
227400 Г5 Коагуля­ционный фактор V 1ц23 Кофактор, входит в состав протромбиназного комп­лекса (П0а + Б5а + Са2+ + фосфолипиды), который осуществляет превращение протромбина в тромбин 16910А

(А^506О1п),

мутация

Лейден

Венозный тромбоз, тромбоз глубо­ких и поверхностных вен, мозговых вен, портальной вены, синдром Бад- да-Киари, артериальный тромбоз, ретинальный тромбоз, тромбоэмбо­лия, ИМ, ИИ, гестоз, преэклампсия, СПП, антенатальная гибель плода, ПОНРП, НЕЬЬР-синдром, ФПН
176930 Г2 Коагуля­ционный фактор 2/ протром­бин 11р11-ц12 Предшественник тромбина 20210 0>А в 3’-концевой некодирую­щей части гена Венозный тромбоз, тромбоз пе­риферических вен, мозговых вен, портальной вены, артериальный тромбоз, тромбоэмболия ТЭЛА, ИИ, ИБС, ИМ, нейросенсорная глухота, гестоз, ПОНРП, невына­шивание беременности на ранних сроках, СЗВРП, ФПН
134830 гав |3-фибри-

ноген

4ц28 Входит в состав фибриноге­на, который под действием тромбина превращается в нерастворимый белок фиб­рин, обеспечивая свертыва­ние крови 0>А в -455 положении промоторной области гена Артериальный тромбоз, тромбоэм­болия, инсульт, ГБ, гестоз
227500 Г7 Коагуля­ционный фактор VII 13ц34 После взаимодействия с тканевым фактором Б7 ак­тивирует Р9 и Р10, запуская каскад коагуляции 109760>А

(А^35301п)

Атеросклероз, тромбоэмболия, ИМ, ГБ, СЗВРП, гипотрофия плода, ФПН
116 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
173360 РАН Ингибитор активатора плазмино­гена 1-го типа 7q21.3-22 Инактивация тканевого активатора плазминогена 50>40 в -675 по­ложении промоторной области гена Венозный тромбоз, тромбоз глу­боких вен, артериальный тромбоз, тромбоэмболия, ИБС, ИМ, гестоз, бесплодие, ранние преэмбриони- ческие и эмбрионические потери, неудачи ЭКО
173370 PLAT Тканевый

активатор

плазмино­

гена

8р12 Активатор плазминогена, катализирует превращение плазминогена в плазмин, запуск фибринолиза 1/0 полимор­физм ИМ, инсульт
173470 ITGB3

(GP3a)

Рецеп­торный гликопро­теин Ша (GPIIIa) 17q21.32 В комплексе с ОРПЬ образует на поверхности тромбоцита рецептор для фибриногена, обеспечивая взаимодействие тромбоцита с фибриногеном и агрега­цию тромбоцитов 1565Т>С

(ЬеиЗЗРго),

РЬА1/РЬА2

Венозный и артериальный тром­бозы, ИБС, синдром внезапной смерти, ИМ, аутизм, гестоз, СЗВРП
192974 ITGA2

(GPIa)

Рецептор­ный гли­копротеин la (GPIa) 5q23-q21 В комплексе с ОРПа форми­рует рецептор для коллагена, обеспечивая адгезию тром­боцитов к субэндотелию 807ОТ Артериальный тромбоз, ИМ в молодом возрасте, ИИ, ФПН
123260 CRP С-реактив- ный белок Iq21-q23 Воспаление (острая фаза), узнает патогены и разру­шенные клетки и иниции­рует их элиминацию -1059О/С

ге3091244

С ердечно-сосудистые заболевания
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 117

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Ангиотензин-рениновая система/Angiotensin-renin system
179820 REN Ренин lq32 Превращение ангиотензино- гена в ангиотензин 1-го типа Met235Thr

(704Т>С)

Артериальная гипертония
106150 AGT Ангиотен-

зиноген

Iq42-q43 Предшественник ангио­тензина. Субстрат для ренина Met235Thr Артериальная гипертония, ИБС, атеросклероз и ИМ
106165 AGTR1 Рецептор 1 -го типа к ангиотен­зину II 3q21-q25 Связывает ангиотензин II. Опосредует вазоконстрик- торную функцию: стиму­ляция синтеза и секреции альдостерона,канальцевая реабсорбция ионов натрия, снижение почечного крово­тока, пролиферация ГМК, гипертрофия сердечной мышцы, стимуляция вы­свобождения вазопрессина и торможение образования ренина 1166А>С Артериальная гипертония, ИБС, атеросклероз и ИМ
300034 AGTR2 Рецептор 2 типа к ангиотен­зину II Xq22-q23 Связывает ангиотензин II. Опосредует вазодилата- торную функцию: на­трийуретическое действие, высвобождение N0 и простациклина, антипроли- феративное действие 3123G>A Артериальная гипертония
118 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
113503 BDKRB2 Рецептор 2-го типа к брадики- нину 14q32.1— 32.2 Связывает брадикинин. Результатом активации эндотелиальных В2 рецепто­ров является вазорелаксация, эффект которой опосредуется стимуляцией эндотелиальной ИО-синтазы и последующей генерацией N0. В2 рецепто­ры на ГМК и кардиомиоци­тах опосредуют сократитель­ный и инотропный эффекты соответственно. Активация В2 рецепторов ассоциирована с антигипертрофическим и/или антипролиферативным эффектами в кардиомиоцитах и фибробластах -58Т>С, I>D Артериальная гипертония, ИБС, атеросклероз и ИМ
Метаболизм гомоцистеина/liomocysteine metabolism
607093 MTHFR Метилен-

тетрагид-

рофолатре-

дуктаза

ІрЗб.З Конверсия гомоцистеина в метионин 677С>Т Венозный и артериальный тромбозы, ТЭЛА, синдром Бадда-Киари, ГБ, ИИ, ИБС, ИМ, шизофрения, дефект зара- щения невральной трубки (spina bifida и анэнцефалия), гестоз, преэклампсия, ПОНРП, СПИ, СЗВРП, антенатальная гибель плода, увеличение толщины внутренней и средней (интимы) со­судистой оболочки и бессимптомный атеросклероз сонной артерии
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 119

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
602568 MTRR 5-метил-

тетрагид-

рофолат-го-

моцистеин

метшпранс-

фераз

редуктаза

5р15.3- р 15.2 Синтез метионина 66A>G

726delTTG

Gly487Arg

Гипоцистонурия, дефект заращения невральной трубки (spina bifida и анэнцефалия), ИБС
Метаболизм адреналина/adrenalin metabolism
109630 ADRB1 Адреноре­цептор В1 10q24-q26 Активирует аденилатцикла- зу через G-белок R389G Артериальная гипертония, эффек­тивность терапии бронхиальной астмы, метаболический синдром
109690 ADRB2 Адреноре­цептор В2 5q32-q34 Активирует аденилатцикла- зу через G-белок 48 A>G, 81 C>G Артериальная гипертония, эффектив­ность терапии бронхиальной астмы
Метаболизм костной ткани
601769 VDR Рецептор

витамина

D

12ql2—14 Рецептор к витамину И, участвует в метаболиз­ме кальция в организме человека Fokl (2 экзон 2T>C), TaqI (9 экзон 352T>C), Apal (A>C), 3731A/G Остеопороз, сахарный диабет 1-го типа (foci, apai, taql полимор­физм —f a, t аллели)
120150 COL1A1 Коллаген I типа а1 17q21.31-

q22

Фибриллярный белок, ос­новной компонент соедини­тельной ткани, обеспечива­ющий ее прочность, входит в состав костей, сухожилий, связок, кожи и др. -1997 G/T 1245 G/T Остеопороз
120 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
112260 BGP Остеокаль­

цин

lq25—31 Основной неколлагеновый белок костной ткани, вита­мин К-зависимый, ответ­ственен за минерализацию кости, связывает кальций и гидроксиапатит, определяет связывание остеокластов с костью и тем самым являет­ся негативным регулятором костного формирования -198С/Т Остеопороз
133430 ESR1

(ER-a)

Рецептор эстрогена 1 6q25.1 Рецептор эстрогена 1 А/G, С/Т Остеопороз
138040 GCCR

(GR)

Глюкокор­

тикоидный

рецептор

5q31 Глюкокортикоидный ре­цептор N363SA/G Остеопороз
114131 CALCR Рецептор

кальцито-

нина

7q21.3 Рецептор к кальцитонину, пептидному гормону участ­вующему в регуляции фос­форно-кальциевого обмена, а также баланса активности остеокластов и остеобластов 463С>Т Остеопороз
Главный локус гистосовместимости
146880 HLA-DQA1 Антиген главного комплекса гистосов­местимос­ти II класса 0(5 альфа 1 6p21.3 Участвует в связывании и экспонировании на поверх­ности макрофагов процес­сированных (связанных) фрагментов различных антигенов *301,*501 (2 экзон) Инсулинзависимый сахарный диа­бет, аутоиммунные заболевания
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 121

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
604305 HLA-DQB1 Антиген главного комплекса гистосов­мести­мости II класса НС) бета 1 6р21.3 Участвует в связывании и экспонировании на поверх­ности макрофагов процес­сированных (связанных) фрагментов различных антигенов *201 *302 (2 экзон) Инсулинзависимый сахарный диа­бет, инсулиннезависимый сахарный диабет, аутоиммунные заболевания. Особо неблагоприятный исход (т. е. манифестация сахарного диабета 1 -го типа) наблюдается при сле­дующих сочетаниях генов DQA1 и DQB1: DQA1 301 DQB1 302 и DQA1 201 DQB1 501
600169 MICA Антиген главного комплекса гистосов­местимос­ти I класса 6р21.33 Экспрессируется на клеточ­ной поверхности, является стресс-индуцированным антигеном *5 *5.1

(GCT 5 экзон)

Аллель 5 предрасполагает к разви­тию сахарного диабета 1-го типа в раннем возрасте (до 14 лет), а аллель 5.1 является фактором риска развития заболевания в более позд­нем возрасте (после 30 лет). Особо неблагоприятный исход наблюда­ется при сочетании этих аллелей с аллелью гена DQB1 201
123890 CTLA4 Т-лим-

фоцит-

ассоции-

рованная

серинэсте-

раза 4

2q33 Передача сигнала Т-клет- кам A49G Замена в 49 положении гена А (нор­ма) на G (мутация) ассоциирована с развитием аутоиммунных заболе­ваний: нарушениями щитовидной железы (болезнь Грейвза, болезнь Эддисона, тиреоидит Хашимото, аутоиммунный гипотиреоидит), инсулинзависимым сахарным диа­бетом, ревматоидным артритом и др.
122 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Воспаление и иммунный ответ
147680 IL2 Интерлей-

кин-2

4q26-q27 Участвует в пролиферации Т- и В-лимфоцитов 330T>G -384 T>G rsl7388568 Инсулинозависимый сахарный диабет, целиакия, рак простаты
147780 IL4 Интерлей-

кин-4

5q31.1 Плейотропный цитокин, активация Т клеток -590ОТ Астма и атопические заболевания
147781 IL4R Альфа-

цепь

рецептора интерлей­кина 4

16р12.1- р 11.2 Трансмембранный белок, связывающий интерлей- кин-4 и 13, регулирует IgE продукцию и запускает дифференциацию Т-хел- перов 2 Gln551Arg Астма, атопические заболевания, ренины и экзема.
147620 IL6 Интерлей-

кин-6

7р21 Плейотропный цитокин, координирующий им­мунный и острофазный воспалительный отве­ты, а также онкогенез и гемопоэз -174С/Т Иммунные нарушения, остеопороз,

ссз

124092 IL10 Интерлей­кин-10 Iq31-q32 Антивоспалительный

цитокин

-592С>А

-1082A>G

-2849A>G

-3575T>A

Иммунные нарушения, ревматоид­ный артрит, псориаз, предраспо­ложенность к заражению вирусом иммунодефицита 1 -го типа
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 123

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
191160 TNFA Фактор

некроза

опухоли

альфа

6р21.3 Разрушение опухолей, иммунный ответ. Провоспа- лительный цитокин, играет важную роль в регуляции нормальной дифференци- ровки, роста и метаболизма различных клеток -3080>А

-238С>А

Сахарный диабет 2-го типа (-238А/0, -308 О/А), бронхиаль­ная астма (-308 О/А), остеопороз, иммунные нарушения
190180 TGFB1 Трансфор­мирующий фактор рос­та бета 1 19ql3.1 Воспаление и регуляция иммунного ответа, контроль пролиферации, дифферен­циации многих типов клеток -509ОТ Т29С С915С Сахарный диабет, атеросклероз, нефропатия, ожирение, болезни легких, муковисцидоз, канцероге­нез, сердечный фиброзис
147570 IFNG Интерфе­рон гамма 12ql4 Воспаление и регуляция иммунного ответа, защита организма от вирусных и бактериальных инфекций -179С-Т -764С>С +874Т>А СА УИОЯ 1349 Острый иммунодефицитный синд­ром, устойчивость к вирусу гепатита С, сахарный диабет, атеросклероз, чувствительность к туберкулезу
603030 TLR4 Трансмем­бранный Тоїі-по- добный рецептор 4 9q32-q33 Сигнальный рецептор воспаления, главная роль в узнавании патогена и активации внутреннего иммунитета Азр299С1у Врожденный иммунный дефицит, гиперчувствительность к эндоток­синам, рак кишечника
Рецепторы/Receptors
601373 CCR5 Трансмем­

бранный

белковый

рецептор

Зр21.31 Служит основным входом для первичных штаммов ВИЧ-1, инфицирующих в первую очередь макрофаги и моноциты Del32 Гомозиготы деі/деї CCR5 обнаружи­вают почти полную устойчивость к ВИЧ-1 инфекции. У гетерозигот заболевание прогрессирует медлен­нее, чем у гомозигот CCR5 +/+
124 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
313700 АК Рецептор

андрогена

Хц11.2-

ц12

Метаболизм стероидных гормонов (САО)(6-40) Рак простаты, рак молочной же­лезы
126450 7Ш72 Рецептор

дофамина

02

11ц23 Медиатор нервной систе­мы, участвует в передаче возбуждающих импульсов, ингибирует активность аденинциклазы геї800497 Формирование алкогольной и нар­котической зависимости. Наличие аллеля А1 ассоциировано с пред­расположенностью к алкоголизму
182135 НТК2А Рецептор серотони­на 2А 13ц14-ц21 Передача сигнала серото­нина 102Т>С

-14380>А

ге7997012

Ожирение, нейропсихические забо­левания, депрессия
192020 БССВІАІ Секрето- глобин 1 семейства 1А 11ц12.3-

цІЗ.І

Ответственен за синтез секреторными клетками бронхов белка, который является основным (более 7 %) компонентом бронхи­альной жидкости АЗ 80 Мутация в 38 положении О на А приводит к снижению количества белка и увеличению риска бронхи­альной астмы у гомозигот А/А в 8 раз и гетерозигот А/О в 4 раза.
603372 ТБНЯ Рецептор

тирео-

стимули-

рующего

гормона

(тиреотро-

пина)

14ц31 Ответственен за изменение активности тиреоидного гормона 0727Е N3721 Азр72701и Замена аспарагина (Б) на глютамин (Е) в 727 кодоне рецептора тирео- тропина ассоциирована с развити­ем гипертиреоидных заболеваний. Инсулинорезистентность
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 125

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Контроль клеточного цикла
164850 шеи Онкоген

ТШС

1р34.2 Транскрипционный фактор, влияющий на клеточную пролиферацию Т/О (Ш) Аллель Б, ассоциирован с повы­шенным риском некоторых типов опухолей и плохим прогнозом при наличии уже диагностированной опухоли, в случае рака легких гено­тип Б/Б ассоциирован с метастаза­ми лимфатических узлов
191170 ТР53 Онкоген

р53

17р 13.1 Контроль деления клетки, ДНК-репарация, апоптоз С13494А, ІПБІбсІеІ, Рго72 А^ Рак, апоптоз, диабетическая поли­нейропатия (72Рго)
147460 8002 Суперок- сиддис- мутаза 2 митохонд­риальная 6ц25.3 Связывание активных форм кислорода, апоптоз АІаІбУаІ

401Т>С

Идиопатическая кардиомиопатия, преждевременное старение, онко­логические заболевания, диабети­ческая нефропатия
Онкомаркеры
113705 ВКСА1

(опухо­

левый

супрессор)

ВЯСАІ

протеин

17ц21 Ядерный белок, участ­вует в таких клеточных процессах, как репарация ДНК, регуляция транс­крипции, клеточный цикл, апоптоз 185йе1АО,

зоот>о,

4153ЙЄІА,

5382шзС

Рак молочной железы, яичников, желудка, толстой кишки
126 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
600185 В КС А 2 (опухо­левый супрессор) ВЯСА2

протеин

13ц12.3 Ядерный белок, участвует в регуляции репарации ДНК, транскрипции и в регуля­ции клеточного цикла 695ііі8Т, 6174ЙЄІТ Рак молочной железы, яичников, желудка, толстой кишки
604373 СНЕК2 Чекпойнт- киназа 2-го типа 22ц12.1 Киназа, в ответ на по­вреждение ДНК вызыва­ет остановку клеточного цикла, инактивирует белки семейства Сс1с25, активи­рует р53 и ВЫСА1 белки и активизирует системы репарации ДНК ШХМеІС Рак молочной железы, рак предста­тельной железы
Метаболизм углеводов
604517 РРАКСС1А Альфа-ко- активатор- 1 гамма- рецептора, активи­руемого пролифе- раторами перокси- сом 4р15.1 Коактиватор многих ядер- ных рецепторов (транс­крипционных факторов), таких как РРАРц. РРАРу. а- и (3-рецепторов эстрогена и минералокортикоидов С1у4828ег 4828егаллель ассоциирован с повышенным риском развития ожирения, сахарного диабета 2-го типа, со сниженным показателем максимального потребления кисло­рода и низкой физической рабо­тоспособностью. Этот же аллель снижает риск развития артериаль­ной гипертензии (обмен минерало­кортикоидов)
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 127

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
608886 PPARGC1B Бета-коак-

тиватор-1

гамма-ре­

цептора,

активи­

руемого

пролифе-

раторами

перокси-

сом

5q33.1 Коактиватор многих ядер- ных рецепторов (транс­крипционных факторов), таких как РРАЫа, РРАЫу, а- и (3-рецепторов эстрогена и минералокортикоидов А1а203Рго Ожирение
113730 UCP1 Разобща­ющий белок 1 4q28-q31 Переносчик анионов и протонов через митохонд­риальную мембрану -3826A>G Ожирение, нарушение термогенеза
601693 UCP2 Разобща­ющий белок 2 1 lql 3 Играет одну из ключевых ролей в терморегуляции, связан с процессами аккумуляции жиров и рассеиванием энергии в виде тепла Ala55Val

-866G>A

Val аллель ассоциирован с повы­шенным риском развития сахарного диабета 2-го типа и ожирением
602044 UCP3 Разобща­ющий белок 3 1 lql 3 Терморегуляция, участвует в процессах митохондри­ального биогенеза -550Т

304G>A

427С>Т

Атеросклероз, сахарный диабет 2-го типа и ожирение
128 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
600409 РРАТЮ Ген рецеп­тора и, активи­руемый пролифе- раторами пероксисом 6р21.1-

р21.2

Выполняет функции по ре­гуляции генов, вовлеченных в окисление ЖК и обмен холестерина Т294С Ожирение, дислипидемия, ате­росклероз и ишемическая болезнь сердца
601487 РРАРО Ген рецеп­тора О, активи­руемый пролифе- раторами перокси­сом Зр25 Функции этого транскрипци­онного фактора заключаются в регуляции генов, связанных с аккумуляцией жира (синтез триглицеридов), диффе- ренцировкой адипоцитов и миобластов, чувствительнос­тью к инсулину, активностью остеобластов и остеокластов (регуляция роста) Рго12А1а Сахарный диабет 2-го типа, ожире­ние, дислипидемия, артериальная гипертензия
170998 РРАЯА Ген рецеп­тора А, активи­руемый пролифе- раторами перокси­сом 22ц13.31 Регуляция обмена липидов, глюкозы и энергетического гомеостаза, а также веса тела и воспалительного про­цесса посредством контроля экспрессии генов, вовлечен­ных в пероксисомальное и митохондриальное окисле­ние, транспорт ЖК, синтез липопротеинов, катаболизм триглицеридов и обмен факторов воспаления 02528С Патологическая и физиологическая гипертрофия миокарда, сахарный диабет 2-го типа, ожирение, дисли­пидемия, атеросклероз и ишеми­ческая болезнь сердца
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 129

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
Гены сигнала инсулина
147440 ЮП Инсулино­подобный фактор 1 (сомато- медин С) 12ц22-ц23 Передача «сигнала инсули­на», влияет на рост, размно­жение и гибель (3-клеток С А повторы (промотор) Сахарный диабет 2-го типа, мета­болический синдром, сердечная недостаточность, ИНСД, ВМБ (с низкой минеральной плотностью костей)
147370 юпк Рецептор

инсулино­

подобного

фактора

роста

15ц26.3 Передача «сигнала инсу­лина» А^108О1п 3174С>А 22930>А 1013О>А Сахарный диабет 2-го типа, метабо­лический синдром, ретинопатия
176730 ІШ Инсулин 11р15.5 Метаболизм глюкозы УОТЯ

(5-ргіте

шйгапзЫес!

regioll)

Сахарный диабет 1-го типа
Другие
116790 сомт Катехол- О-метил- трансфера- за (СОМТ) 22ц11.2 Катехоламины осуществля­ют синаптическую передачу нервного импульса в цен­тральной и вегетативной нервных системах (являют­ся нейромедиаторами) У158М

А1а728ег

Психические заболевания, болезнь Паркинсона, главный ген в патоге­незе гестоза
604824 КТ Клото 13ц12 Энергетический обмен, внутриклеточный сигна- линг -395 0>А 578А>0 1818 С>Т Остеопения, атеросклероз, хрони­ческая почечная недостаточность
130 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
604479 SIRT1 Сиртуин 1 10ц21.3 Деацетилирование белков, регуляция генов семейства РОХО rs7069102

rs3758391

Воспаление, сопровождающее артриты и артрозы, астма, сердеч­но-сосудистые патологии, ней- родегенеративные расстройства, ожирение, когнитивная функция
604481 SIRT3 Сиртуин 3 11р15.5 Энергетический обмен 477G>T VNTR 72-bp repeat core in intron 5 Нарушение обмена веществ
176887 PTPN2 Протеин- тирозин фосфатаза, не-рецеп- тор 2 18р11.3-

р 11.2

Осуществляет дефосфори­лирование фактора БТАП, одного из главных регуля­торов передачи сигналов иммунного ответа, в том числе и в системе регуля­ции синтеза интерлейкина 2 rs2542151 Сахарный диабет 1-го типа
600716 PTPN22 Протеин- тирозин фосфатаза, не-рецеп- тор 22 ІрІЗ.З-

різ.1

Осуществляет дефосфори­лирование белков, передаю­щих сигнал от антигенных рецепторов Т-клеток и рецепторов цитокинов C1858T Сахарный диабет 1 -го типа, ревма­тоидный артрит, красная волчанка
120353 ММР1 Матрикс- ная метал- лопротеаза 1(калоге- наза) 11ц22.3 Контроль эмбрионального развития, репродукции и ремоделирования тканей -1607OGG Хронический периодонтит, рак лег­кого, повышение риска метастази- рования в лимфоузлы у пациенток с РМЖ и генотипом 20/20
5. Список генов, для которых показана ассоциация с заболеваниями 131

ОМІМ

Обозначе­ние гена Название

продукта

Локализа­ция гена Функция Основной

полиморфизм

Ассоциации с болезнями
102574 АСШЗ а-акти-

нин-3

11ц13-ц14 Продукт А СТЫЗ является основным компонентом 2-линий мышечных сарко- меров, а также определяет развитие быстрых мышеч­ных волокон II типа Я577Х (1747 ОТ) Определяет преобладающий тип поперечно-полосатых мышечных волокон, предрасположенность к скоростно-силовым видам спорта
601302 РРРЗК1

(СЖ1)

Кальце-

неврин

2р16-р15 Продукт синтеза данного гена входит в состав регуля­торной субъединицы Са2+-модул ин фо сф отазы, являющейся одним из основных регуляторов концентрации ионов Са в организме 51/50 Левожелудочковая гипертрофия сердца
102770 АМРВ1 Аденозин- монофос- фат деза- миназа ІрІЗ.1 Продуктом синтеза являет­ся специфическая скелет­но-мускульная аденозин- монофосфат дезаминаза (М-изоформа), участвую­щая в процессах азотистого обмена С34Т Левожелудочковая гипертрофия сердца
132 Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины

<< | >>
Источник: БарановВ.С.. Генетический паспорт — основа индивидуальной и предик­тивной медицины / Под ред. В. С. Баранова. — СПб.: Изд-во Н-Л,2009. — 528 с.: ил.. 2009

Еще по теме ВВЕДЕНИЕ:

  1. ВВЕДЕНИЕ
  2. ВВЕДЕНИЕ
  3. ВВЕДЕНИЕ
  4. ВВЕДЕНИЕ
  5. ВВЕДЕНИЕ
  6. ВВЕДЕНИЕ
  7. 1. ВВЕДЕНИЕ
  8. ВВЕДЕНИЕ
  9. Введение
  10. ВВЕДЕНИЕ
  11. ВВЕДЕНИЕ
  12. ВВЕДЕНИЕ
  13. Введение
  14. Введение
  15. ВВЕДЕНИЕ