<<
>>

ВВЕДЕНИЕ

Как уже отмечалось (см. главу 2), полиморфизм и мутации — яв­ления одного порядка, суть которого составляют изменения структуры ДНК. Естественно, что и методы, применяемые для идентификации ал­лельных вариантов, то есть для изучения полиморфизма генов, те же, что и используемые для поиска мутаций.

Важнейшим итогом исследований по изучению генома человека был серьезный прорыв в разработке удобных, недорогих и эффективных ме­тодов детекции мутаций, то есть определения количественных и качест­венных изменений первичной структуры молекулы ДНК [30, 142, 360].

Для поиска и идентификации мутаций (ДНК-полиморфизма) в на­стоящее время разработаны и широко применяются различные методы, общее число которых приближается к ста. Основу подавляющего боль­шинства таких методов составляет знаменитая полимеразная цепная реакция (ПЦР), открытие которой принесло ее автору, американскому ученому Кэрри Муллису, Нобелевскую премию 1992 г. Перечень наибо­лее часто используемых в практике молекулярно-генетических методов приведен в таблице 4.1.

В зависимости от целей исследования все молекулярно-генетичес­кие методы можно подразделить на две группы: методы, направленные на поиск неизвестных мутаций (первичная идентификация) и анализ из­вестных мутаций. Естественно, что в отличие от моногенных болезней, где нередко стоит задача идентификации неизвестной мутации в извес­тном гене, при изучении аллельных ассоциаций МФЗ объектом иссле-

Таблица 4.1

Наиболее распространенные молекулярно-генетические методы идентификации мутаций

Молекулярно-генетические методы

1. Полиморфизм длин амплифицированных фрагментов (AFLP)

2. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов (RFLP)

3. Расщепление резолвазой (EMD)

4. Методы, основанные на лигазной реакции (LDL, LCR, Padlock)

5. Инвазивное расщепление олигонуклеотидов (расщепление Clevase I)

6. Случайная амплификация полиморфной ДНК (RAPD, AP-PCR)

7. ПЦР с прямой терминацией синтеза (DT-PCR)

8. Анализ конформации одноцепочечных фрагментов ДНК (SSCP)

9. Гетеродуплексный анализ

10. Секвенирование ДНК

11. Минисеквенирование

12. Аллель-специфическая ПЦР

13. Масс-спектрометрия

14. ПЦР в реальном времени

15. Микрочипы дования являются уже известные полиморфные сайты, информацию о которых можно найти в соответствующих ДНК-базах, опубликованных в Интернете (см. гл. 1, 2). Вместе с тем нам представляется целесообраз­ным кратко рассмотреть базовые методы детекции мутаций (полимор­физма) и подробней остановиться на наиболее перспективных современ­ных методах молекулярно-генетического анализа полиморфных сайтов.

<< | >>
Источник: БарановВ.С.. Генетический паспорт — основа индивидуальной и предик­тивной медицины / Под ред. В. С. Баранова. — СПб.: Изд-во Н-Л,2009. — 528 с.: ил.. 2009

Еще по теме ВВЕДЕНИЕ:

  1. ВВЕДЕНИЕ
  2. ВВЕДЕНИЕ
  3. ВВЕДЕНИЕ
  4. ВВЕДЕНИЕ
  5. ВВЕДЕНИЕ
  6. ВВЕДЕНИЕ
  7. 1. ВВЕДЕНИЕ
  8. ВВЕДЕНИЕ
  9. Введение
  10. ВВЕДЕНИЕ
  11. ВВЕДЕНИЕ
  12. ВВЕДЕНИЕ
  13. Введение
  14. Введение
  15. ВВЕДЕНИЕ
  16. Введение
  17. Введение
  18. Введение
  19. Введение