ОЦЕНКА РЕЗУЛЬТАТОВ ПРЕДИКТИВНОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТЕСТИРОВАНИЯ
Генетическое тестирование все шире внедряется в клиническую практику, что стимулируется возрастающими потребностями населения в высоких технологиях охраны здоровья. При этом самым слабым звеном в предиктивной медицине остается оценка результатов генетического тестирования, которая должна проводиться с учетом уже накопленных знаний по генным сетям конкретных МФЗ, популяционных, гендерных и возрастных особенностей частот полиморфных аллелей (см.
9.1).Учитывая сугубо вероятностный характер генетических прогнозов при тестировании наследственной предрасположенности к МФЗ, определенную помощь в оценке риска наследственной предрасположенности уже сегодня может дать достаточно простой метод балльных оценок, который применяется в ряде западных стран (Harvard School of Public Health). Он также используется в некоторых отечественных центрах, проводящих генетическое тестирование (НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН, НИИ АГ им. Д. О. Отта СЗО РАМН) [97, 159, 168]. Суть метода заключается в следующем: каждый вариант генотипа оценивается в условных баллах в зависимости от того, являются ли выявленные аллели протективными или предрасполагающими к развитию патологии.
По исследованным генам суммируют все баллы и условно оценивают риск заболевания как средний, низкий или высокий (см. пример в разделе 6.5). Некоторые варианты балльных оценок помимо обсчета баллов генотипов включают в себя также условные баллы для различных экзогенных факторов (вредные воздействия, привычки, прием лекарственных препаратов и пр.) и антропометрические данные, а также физическую активность, пол, вес.После генетического тестирования обследуемый получает заключение, в котором указаны протестированные гены, их полиморфные варианты; согласно генотипу дается оценка риска с указанием, при необходимости, дальнейших лечебно-диагностических и профилактических мероприятий.
Эта информация подготавливается врачом-генетиком совместно со специалистом, проводившим молекулярный анализ, и передается отдельно лечащему врачу и пациенту. Сопоставление этого заключения с результатами клинических, лабораторных и инструментальных исследований позволяет оценить риск развития того или иного МФЗ и предложить максимально эффективную программу профилактики и лечения.Следует иметь в виду, что такой упрощенный вариант оценки индивидуального риска скорее подходит для анализа результатов генетического тестирования в пределах одной достаточно четко очерченной генной сети, контролирующей одну метаболическую цепь (например, системы детоксикации, свертывания крови, сосудистого тонуса, липидного обмена). Суммировать баллы по генам разных сетей, совместно вовлеченных в патогенез большинства МФЗ (бронхиальная астма, остеопороз, сердечно-сосудистые заболевания, эндометриоз и др.) вряд ли оправданно. В таком случае лучше проводить подсчет баллов по каждой генной сети отдельно и затем, сопоставляя полученные результаты с данными лабораторных и клинических исследований, пытаться решить, к какой группе риска следует отнести тестируемого пациента.
Ответ может быть более объективным, если есть возможность сравнить полученные результаты с данными по генетическому тестированию близкого родственника, уже имеющего данное МФЗ. В любом случае ответ будет носить сугубо вероятностный характер.
Существенную помощь в правильной интерпретации полученных результатов может оказать специальная компьютерная программа. Один из ее вариантов разработан во Франции и уже используется в медицинской практике [44]. Ее главная отличительная особенность заключается в рациональном совмещении результатов генетического тестирования с клиническими и анамнестическими данными, на основании которых составляется заключение, даются конкретные рекомендации по сохранению здоровья и профилактике болезней. Основной упор при этом делается на оценку результатов различных генетических тестов, прежде всего, тестов по определению аллельного полиморфизма генов системы детоксикации.
Необходимость такой программы продиктована всем ходом становления и развития предиктивной медицины. Действительно, информация об особенностях аллельного паттерна различных генных панелей, обработанная с помощью такой программы, позволяет врачу-генетику получить достаточно объективную информацию о предрасположенности субъекта к тому или иному заболеванию, более обоснованно судить о его медицинском прогнозе, более аргументированно проводить медико-генетическое консультирование по вопросам специального образования, выбора профессии, занятиям спортом и фитнесом, диетотерапии и пр.Разработаны и уже используются специальные компьютерные программы, позволяющие проводить сравнение геномных профилей больных с МФЗ, контрольной группы и конкретного пациента и оценивать риск наследственной предрасположенности к МФЗ конкретного человека [723]. Кроме того, международной группой ученых завершено создание карты большинства основных комбинаций в геноме человека. Карта облегчает врачам проведение анализа результатов тестирования, помогает находить генные вариации, соответствующие определенным заболеваниям, и отслеживать их передачу по наследству. Считается, что такая карта поможет снизить стоимость поиска генов предрасположенности к тому или иному МФЗ, а также сделает реальным разработку индивидуального лечения [502]. Нет сомнений в том, что создание подобной компьютерной программы для оценки результатов генетического тестирования в России также могло бы существенно ускорить внедрение предиктивной медицины в клиническую практику.
Согласно зарубежным данным, уже разработаны и достаточно широко используются тесты для оценки наследственной предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям, венозным тромбозам, гиперлипидемии, атеросклерозу [502]. Быстро увеличивается число тестов на определение индивидуальной чувствительности к лекарственным препаратам (см. раздел 7.2). Частными коммерческими центрами Америки и Европы разработаны и уже широко практикуются различные панели генов и полиморфных сайтов (ПС).
Так, диагностический центр по предиктивной медицине в Люксембурге (Laboratoires Reunis) предлагает для практикующих врачей-специалистов в области медицины антистарения устоявшиеся и уже хорошо зарекомендовавшие себя на практике следующие панели генов: специальной физической активности (25 генов, 28 ПС), кардиоваскулярного риска и стресса (19 генов, 22 ПС), метаболизма кальция и остеопороза (9 генов, 11 ПС), стоматологическая панель (8 генов, 10 ПС), рака простаты (1 локус, 10 ПС), специальной дерматогеномики (6 генов, 7 ПС), фармакогенетическая панель (6 генов, 17 ПС), ВИП-панель (47 генов, 64 ПС), нутригеномная панель (14 генов,18 ПС), панель антистарения (19 генов, 24 ПС), панель женского здоровья (23 гена, 28 ПС), панель мужского здоровья (19 генов, 23 ПС) (www.i-e-p-p.org). Естественно, что применяемые генетические анализы пока не имеют сертификации тестов, пригодных для клинического применения, однако они широко используются практикующими специалистами, в том числе и врачами, работающими в области медицины антистарения. Кстати, на уровне генетических анализов находятся еще более 1 000 предиктивных генетических тестов, многие из которых проходят доклинические и клинические испытания. Среди них такие гены, как APOE аллель е4, гомозиготность по которому в 14 раз увеличивает риск болезни Альцгеймера у европейцев, ген Filaggrin, мутации которого R501X или 2282del14 в 4 раза увеличивают риск атопической экземы и тяжелых форм бронхиальной астмы, неблагоприятные аллели гена CDKN22a2b (на 64 % увеличивают риск ИМ) и гена INK 4a/4b (вдвое возрастает риск диабета тип 2). Однако клиническое значение этих генетических тестов остается неясным, их полезность для врачей и пациентов требует более строгих доказательств [453].16 августа 2007 года успешно прошел сертификацию и получил официальное одобрение Администрации по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными препаратами США (Food & Drug Administration) первый предиктивный генетический тест для расчета индивидуальной дозы антикоагулянта варфарина. Тест включает в себя
результаты генетического тестирования генов CYP2C9, VKORC1 + возраст + пол + вес пациента.
Таким образом, несмотря на уже существующий массив данных, официально разрешенным для клинического применения в настоящее время является только тест на чувствительность к варфарину. Комиссией EuroGentest в Европе также разработано специальное положение о стандартизации генетического тестирования и подготовлена необходимая документация для сертификации тех генетических анализов, которые по результатам клинических испытаний могут быть уже переведены в разряд генетических тестов и, соответственно, могут быть рекомендованы для широкого клинического применения [347; http://www. eurogentest.org/unit/wotkshops.xhtml].
Еще по теме ОЦЕНКА РЕЗУЛЬТАТОВ ПРЕДИКТИВНОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТЕСТИРОВАНИЯ:
- БарановВ.С.. Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины / Под ред. В. С. Баранова. — СПб.: Изд-во Н-Л,2009. — 528 с.: ил., 2009
- Особые генетические формы
- ГЛАВА 6 ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ В ИММУНОЛОГИИ
- ЛИНИИ МЫШЕЙ С ГЕНЕТИЧЕСКИМИ ДЕФЕКТАМИ, ЗАТРАГИВАЮЩИМИ ИММУННУЮ СИСТЕМУ
- Как добиться хороших результатов в школе
- Как добиться хороших результатов в школе
- Результат
- Результаты исследования и их обсуждение
- Цель и побочный результат
- Требования к результатам иммунотропной терапии
- РЕЗУЛЬТАТЫ ВОСПИТАНИЯ, ОСНОВАННОГО НА СТРАХЕ
- Формирование финансового результата в бухгалтерском учете
- Наши болезни – результат наших мыслей
- Правило 1. Знание о своем намерении (результате)
- Рак — это результат чрезвычайной дегенерации клеток